نُشرت الدراسة الأكثر شمولاً للجينوم البشري الفيتنامي في مجلة Nature Communications.

نُشرت الدراسة الأكثر شمولاً للجينوم البشري الفيتنامي في مجلة Nature Communications.
الأستاذ فو ها فان (يسار) والدكتور فو سي نام هما المؤلفان الرئيسيان للمقال.
الأستاذ فو ها فان (يسار) والدكتور فو سي نام هما المؤلفان الرئيسيان للمقال.

نشر فريق من العلماء بقيادة الدكتور فو سي نام، الرئيس التنفيذي لمعهد أبحاث البيانات الضخمة بجامعة فينوني، والبروفيسور فو ها فان، المدير العلمي للمعهد، بحثهم بعنوان “VN1K هو مورد متعدد الأوميات والفينوميات مستوحى من الجينوم الشامل للسكان الفيتناميين” في مجلة Nature Communications – إحدى المجلات العلمية المرموقة الرائدة في العالم.

يُقدّم هذا المشروع أول مجموعة بيانات شاملة وواسعة النطاق للجينوم، وعلم الجينوم المتعدد، والنمط الظاهري للسكان الفيتناميين، ويُؤسس بنجاح مرجع الجينوم الشامل الفيتنامي (VPR) – وهو أول مرجع جينومي خاص بالسكان الفيتناميين. ويُعتبر هذا أساسًا علميًا بالغ الأهمية للبحوث الجينية والعديد من التطبيقات في الطب الدقيق، والطب الوقائي، وفك شفرة الجينات للسكان الفيتناميين.

تم تنفيذ المشروع بواسطة فريق بحثي يضم أكثر من 40 عالماً فيتنامياً، بقيادة الدكتور فو سي نام والبروفيسور فو ها فان: الأستاذ المشارك لي دوك هاو (جامعة هانوي للعلوم والتكنولوجيا)، والأستاذ المشارك نغوين ثوي دوونغ (أكاديمية فيتنام للعلوم والتكنولوجيا)، والأستاذ المشارك لي ثي لي (جامعة فيتنام الوطنية في مدينة هو تشي منه)، والبروفيسور لي سي فينه (جامعة فيتنام الوطنية في هانوي)، والبروفيسور نغوين ثانه ليم (جامعة فين يوني)، والبروفيسور تران هوي ثينه (جامعة هانوي الطبية)، والأستاذ المشارك نغوين هوانغ كوان (جامعة كوينزلاند، أستراليا)، والأستاذ المشارك ليو نغوين هونغ (معهد هيوستن ميثوديست للأبحاث وجامعة كورنيل، الولايات المتحدة الأمريكية) والعديد من العلماء الشباب الموهوبين الآخرين.

بدأ المشروع في عام 2018 في معهد أبحاث البيانات الضخمة (الذي أصبح الآن جزءًا من جامعة فينوني)، بهدف بناء قاعدة بيانات جينومية واسعة النطاق خاصة بالشعب الفيتنامي وتعزيز تطبيقات علم الوراثة في الرعاية الصحية ومجالات خدمة المجتمع الأخرى.

تم تطوير VN1K بناءً على تحليل بيانات 1011 شخصًا فيتناميًا من أصل 53/63 مقاطعة ومدينة (وفقًا للحدود الإدارية في وقت أخذ العينات)، حيث تم تسجيل أكثر من 42 مليون متغير جيني، منها ما يقرب من 8.5 مليون متغير لم يتم تسجيلها أبدًا في قواعد البيانات الدولية الشائعة.

انطلاقاً من مصدر البيانات هذا، قام فريق البحث بتطوير المرجع الجينومي الشامل الفيتنامي (VPR) – وهو أول مرجع جينومي سكاني واسع النطاق في فيتنام، مما يحسن دقة تحليل وتفسير الاختلافات الجينية مقارنة باستخدام الجينومات المرجعية المبنية أساساً من السكان الأوروبيين.

في السابق، كانت البيانات الجينية للشعب الفيتنامي في الدراسات الدولية محدودة للغاية. وقد أدى هذا النقص إلى عدم انعكاس الخصائص الجينية للشعب الفيتنامي بشكل كامل في العديد من الدراسات المتعلقة بالأمراض، والاستجابة للأدوية، وتطبيقات الطب الدقيق. إن نجاح تطوير مشروع VN1K لا يُسهم فقط في سدّ النقص في البيانات المتعلقة بفيتنام على خريطة الجينات العالمية ، بل يُضيف أيضًا مصدرًا ضخمًا للبيانات إلى جنوب شرق آسيا، إحدى أكثر المناطق التي تفتقر إلى الموارد الجينية المتاحة حاليًا.

قد يعجبك أيضاً

منذ إطلاقه في عام 2018، لم يهدف مشروع “فك شفرة 1000 جينوم بشري فيتنامي” إلى بناء قاعدة بيانات للبحوث الأساسية فحسب، بل أيضًا إلى إنشاء أساس للتطبيقات الطبية الحيوية المصممة خصيصًا للخصائص الجينية للشعب الفيتنامي.

vingenchip-do-cong-ty-genstory-phat-trien-dua-tren-nen-tang-vn1k-hien-la-mot-trong-nhung-cong-nghe-dang-duoc-su-dung-trong-du-an-ngan-hang-gen-liet-sy-va-than-nhan-do-nha-nuoc.jpg
تُعد شريحة VinGenChip، التي طورتها شركة Genstory استنادًا إلى منصة VN1K، حاليًا واحدة من التقنيات المستخدمة في مشروع بنك الجينات للجنود الشهداء وأقاربهم.

باستخدام بيانات VN1K، حدد العلماء العديد من المتغيرات الجينية المرتبطة بردود الفعل السلبية تجاه بعض الأدوية الشائعة مثل كاربامازيبين، وألوبيورينول، وكلوبيدوجريل. وبناءً على ذلك، طُوّرت نماذج للتنبؤ باستجابة الجسم للأدوية استنادًا إلى الخصائص الجينية لما يقرب من 150 فئة دوائية، مما يساعد الأطباء في اختيار الأدوية وتعديل جرعات العلاج بشكل أكثر ملاءمة لكل مريض.

أحد التطبيقات المنفذة هو مشروع “الدواء المناسب للأطفال”، الذي يساعد آلاف الأطفال المحرومين المصابين بالصرع على تلقي الاختبارات الجينية قبل العلاج، مما يقلل من خطر حدوث ردود فعل دوائية خطيرة ويحسن من فعالية العلاج.

من أبرز إنجازات VN1K شريحة VinGenChip، وهي أول شريحة حيوية مصممة استنادًا إلى بيانات الجينوم البشري الفيتنامي. وقد طورتها شركة GeneStory بناءً على نتائج أبحاث VN1K، ويمثل هذا المنتج خطوة هامة نحو إتقان التقنيات الأساسية لتحليل البيانات الجينية وتصميم الشرائح الحيوية في فيتنام.

تستطيع شريحة VinGenChip تحليل عشرات الآلاف من المتغيرات الجينية المميزة للشعب الفيتنامي في آنٍ واحد، ما يخدم أغراضًا متنوعة كالتحديد الشخصي، والتنبؤ بالاستجابة للأدوية، وفحص مخاطر الأمراض، ودراسات علم الوراثة السكانية. ويُسهم تحسين بيانات الجينوم البشري الفيتنامي في تعزيز دقة التطبيقات العملية، ويُمهد الطريق لتقنيات فك شفرة الجينات المتاحة لعامة الناس.

تُعدّ تقنية VinGenChip حاليًا إحدى التقنيات المستخدمة في مشروع بنك الجينات للجنود الشهداء وأقاربهم، بالإضافة إلى حملة الـ 500 يوم للعثور على قبور الجنود الشهداء، التي تنفذها الدولة على نطاق واسع يصل إلى ملايين عينات الحمض النووي. وبفضل قدرتها على قراءة عدد كبير من المتغيرات الجينية القيّمة في آنٍ واحد لأغراض التعرّف على الهوية، تُسهم هذه التقنية في تحسين دقة مطابقة البيانات بين عينات الحمض النووي من الأقارب والرفات، مع خفض التكاليف بشكل ملحوظ مقارنةً بالعديد من الحلول المستوردة.

من المتوقع أن يُسهم تطبيق تقنية VinGenChip على منصة بيانات الجينوم البشري الفيتنامي في تحسين كفاءة تحديد رفات الشهداء الذين تنقصهم المعلومات، وهو ما يخدم مهمة ذات أهمية تاريخية وسياسية وإنسانية خاصة. كما يُبرهن هذا على القدرة على تحويل نتائج البحث العلمي إلى تقنيات تلبي الاحتياجات العملية للبلاد.

علاوة على ذلك، يتوقع فريق البحث أن يظل مشروع VN1K منصة للعديد من التطبيقات الجديدة في الطب الدقيق والطب الوقائي والرعاية الصحية الشخصية، مما يساهم في تقريب إنجازات علم الوراثة من نظام الرعاية الصحية الفيتنامي والشعب.

صرح البروفيسور فو ها فان، صاحب فكرة المشروع: “هذا مشروعٌ نفّذه بالكامل خبراء فيتناميون في فيتنام، من أجل الشعب الفيتنامي، وهو مشروع رائد بطبيعته، إذ يرسي الأساس لبحث شامل حول الجينوم البشري الفيتنامي. ونأمل أن تكون هذه الخطوة الأولى في سلسلة من الأعمال اللاحقة ذات القيمة الأكاديمية الكبيرة.”

صرح الدكتور فو سي نام، الباحث الرئيسي والمؤلف المشارك الأساسي للدراسة: “منذ البداية، لم يكن هدفنا مجرد بناء قاعدة بيانات ضخمة وأدوات إحصائية وذكاء اصطناعي فعّالة للبيانات الجينية البشرية الفيتنامية، بل أيضاً إنشاء منصة تُحوّل نتائج الأبحاث إلى تطبيقات تخدم المجتمع. نتوقع أن يُسهم مشروع VN1K في تعزيز تطبيقات الطب الوقائي والطب الدقيق في فيتنام، وأن يُحقق فوائد عملية للشعب الفيتنامي.”

المصدر: