يناقش الدكتور فو سي نام تقنية فك شفرة الجينات مع زملائه.
يناقش الدكتور فو سي نام تقنية فك شفرة الجينات مع زملائه.
نشر فريق من العلماء الفيتناميين بقيادة الدكتور فو سي نام، المدير التنفيذي لمعهد أبحاث البيانات الضخمة (جامعة فين يوني)، والبروفيسور فو ها فان، المدير العلمي للمعهد، دراسة بعنوان “VN1K هو مورد متعدد الأوميات والفينوميات مستوحى من الجينوم الشامل للسكان الفيتناميين” في مجلة Nature Communications.
يقدم هذا المشروع أول مجموعة بيانات شاملة وواسعة النطاق للجينوم والبوليوميات والنمط الظاهري للسكان الفيتناميين، وينجح في تطوير مرجع الجينوم الشامل الفيتنامي (VPR) – وهو أول جينوم مرجعي خاص بالسكان الفيتناميين.
يعتبر هذا أساسًا علميًا هامًا للبحوث الجينية والعديد من التطبيقات في الطب الدقيق والطب الوقائي وفك شفرة الجينات لصالح الشعب الفيتنامي.

يقوم الباحثون في المشروع بفحص نتائج فك شفرة الجينات في المختبر.
بدأ المشروع في عام 2018، بمشاركة أكثر من 40 عالماً فيتنامياً. قام فريق البحث بتحليل بيانات 1011 شخصاً فيتنامياً من 53 محافظة ومدينة من أصل 63، مسجلاً أكثر من 42 مليون متغير جيني، منها حوالي 8.5 مليون متغير لم تظهر من قبل في قواعد البيانات الدولية الشائعة.
انطلاقاً من مصدر البيانات هذا، قام العلماء بتطوير المرجع الجينومي الشامل الفيتنامي (VPR) – وهو أول مرجع جينومي سكاني واسع النطاق في فيتنام، والذي يحسن دقة تحليل وتفسير التباين الجيني لدى الشعب الفيتنامي مقارنة بالمرجع الجينومي الحالي، والذي تم بناؤه بشكل أساسي من البيانات الأوروبية.
قد يعجبك أيضاً
في السابق، كانت البيانات الجينية المتعلقة بالشعب الفيتنامي في الدراسات الدولية محدودة للغاية. وقد أدى هذا النقص إلى عدم انعكاس الخصائص الجينية للسكان الفيتناميين بشكل كامل في العديد من الدراسات المتعلقة بعلم الأمراض، والاستجابة للأدوية، وتطبيقات الطب الدقيق.
ووفقًا لفريق البحث، فإن إنشاء VN1K بنجاح لا يكمل البيانات المفقودة لفيتنام على خريطة الجينوم العالمية فحسب، بل يساهم أيضًا في توفير مصدر بيانات مهم لجنوب شرق آسيا – وهي منطقة لا تزال تفتقر إلى البيانات الجينية واسعة النطاق.
باستخدام بيانات VN1K، حدد العلماء العديد من المتغيرات الجينية المرتبطة بردود الفعل السلبية للعديد من الأدوية الشائعة، وقاموا بتطوير نماذج تنبؤية لاستجابة الأدوية لما يقرب من 150 فئة دوائية، مما يساهم في تخصيص العلاج.

توضح الصورة النتائج الرئيسية للورقة البحثية.
أحد التطبيقات المنفذة هو مشروع “الدواء المناسب للأطفال”، الذي يساعد آلاف الأطفال المحرومين المصابين بالصرع على تلقي الاختبارات الجينية قبل العلاج، مما يقلل من خطر حدوث ردود فعل دوائية خطيرة ويحسن من فعالية العلاج.
من أبرز تطبيقات هذا المشروع شريحة VinGenChip ، وهي أول شريحة حيوية مصممة استنادًا إلى بيانات الجينوم البشري الفيتنامي. تتميز هذه التقنية بقدرتها على تحليل عشرات الآلاف من المتغيرات الجينية في آن واحد، ما يخدم أغراضًا مثل تحديد هوية الأفراد، والتنبؤ بالاستجابة للأدوية، وفحص مخاطر الإصابة بالأمراض، وأبحاث علم الوراثة السكانية.
حالياً، تعد تقنية VinGenChip واحدة من التقنيات المستخدمة في مشروع بنك الجينات للشهداء وأقاربهم، بالإضافة إلى الحملة التي تستمر 500 يوم للبحث عن رفات الشهداء وجمعها وتحديد هويتها، والتي يتم تنفيذها على نطاق ملايين عينات الحمض النووي.
بفضل القدرة على قراءة عدد كبير من المتغيرات الجينية القيّمة في وقت واحد لأغراض تحديد الهوية، تساهم هذه التقنية في تحسين دقة مطابقة البيانات بين عينات الحمض النووي من الأقارب والرفات، مع تقليل التكاليف بشكل كبير مقارنة بالعديد من الحلول المستوردة.
من المتوقع أن يُسهم تطبيق تقنية VinGenChip على منصة بيانات الجينوم البشري الفيتنامي في تحسين كفاءة تحديد رفات الشهداء الذين تنقصهم المعلومات، وهو ما يخدم مهمة ذات أهمية تاريخية وسياسية وإنسانية خاصة. كما يُبرهن هذا على القدرة على تحويل نتائج البحث العلمي إلى تقنيات تلبي الاحتياجات العملية للبلاد.
وفي معرض حديثه عن أهمية المشروع، ذكر البروفيسور فو ها فان أن هذا البحث قد أجراه بالكامل علماء فيتناميون في فيتنام، من أجل الشعب الفيتنامي، وهو بحث رائد، يضع الأساس لبحث شامل حول الجينوم البشري الفيتنامي في المستقبل.
وفي الوقت نفسه، أكد الدكتور فو سي نام أن هدف المجموعة ليس فقط بناء قاعدة بيانات وأدوات الذكاء الاصطناعي للبيانات الجينية البشرية الفيتنامية، ولكن أيضًا تحويل نتائج البحث إلى تطبيقات تخدم المجتمع، مما يساهم في تطوير الطب الوقائي والطب الدقيق في فيتنام.
ثو جيانغ
المصدر:
