نشر فريق من العلماء بقيادة الدكتور فو سي نام، المدير التنفيذي لمعهد أبحاث البيانات الضخمة بجامعة فين يوني، والبروفيسور فو ها فان، المدير العلمي للمعهد، دراسة بعنوان “VN1K هو مورد متعدد الأوميات والفينوميات مستوحى من الجينوم الشامل للسكان الفيتناميين” في مجلة Nature Communications – إحدى المجلات العلمية المرموقة الرائدة في العالم.
يُقدّم هذا المشروع أول مجموعة بيانات شاملة وواسعة النطاق للجينوم، وعلم الجينوم المتعدد، والنمط الظاهري للسكان الفيتناميين، ويُؤسس بنجاح مرجع الجينوم الشامل الفيتنامي (VPR) – وهو أول مرجع جينومي خاص بالسكان الفيتناميين. ويُعتبر هذا أساسًا علميًا بالغ الأهمية للبحوث الجينية والعديد من التطبيقات في الطب الدقيق، والطب الوقائي، وفك شفرة الجينات، بما يعود بالنفع على السكان الفيتناميين.



الباحثون الرئيسيون المشاركون في مشروع فك شفرة 1000 جينوم بشري فيتنامي.
أُجري البحث من قبل أكثر من 40 عالماً فيتنامياً تحت قيادة الدكتور فو سي نام والبروفيسور فو ها فان، بمشاركة الأستاذ المشارك لي دوك هاو (جامعة هانوي للعلوم والتكنولوجيا)، والأستاذ المشارك نغوين ثوي دوونغ (أكاديمية فيتنام للعلوم والتكنولوجيا)، والأستاذ المشارك لي ثي لي (جامعة فيتنام الوطنية في مدينة هو تشي منه)، والبروفيسور لي سي فينه (جامعة فيتنام الوطنية في هانوي)، والبروفيسور نغوين ثانه ليم (جامعة فين يوني)، والبروفيسور تران هوي ثينه (جامعة هانوي الطبية)، والأستاذ المشارك نغوين هوانغ كوان (جامعة كوينزلاند، أستراليا)، والأستاذ المشارك ليو نغوين هونغ (معهد هيوستن ميثوديست للأبحاث وجامعة كورنيل، الولايات المتحدة الأمريكية) والعديد من العلماء الشباب.
بدأ المشروع في عام 2018 في معهد أبحاث البيانات الضخمة (الذي أصبح الآن جزءًا من جامعة فينوني)، بهدف بناء قاعدة بيانات جينومية واسعة النطاق خاصة بالشعب الفيتنامي وتعزيز تطبيق علم الوراثة في الرعاية الصحية.
استكمال الجزء المفقود من خريطة الجينوم البشري الفيتنامي.
تم تطوير VN1K بناءً على تحليل بيانات 1011 شخصًا فيتناميًا من 53 مقاطعة ومدينة من أصل 63، حيث تم تسجيل أكثر من 42 مليون متغير جيني، منها حوالي 8.5 مليون متغير لم تظهر أبدًا في قواعد البيانات الدولية الشائعة.
انطلاقاً من مصدر البيانات هذا، قام فريق البحث بتطوير المرجع الفيتنامي الشامل للجينوم (VPR)، والذي يحسن دقة تحليل وتفسير الاختلافات الجينية مقارنة باستخدام الجينومات المرجعية التي تم إنشاؤها في المقام الأول من السكان الأوروبيين.
بحسب فريق البحث، كانت البيانات الجينية للشعب الفيتنامي في الدراسات الدولية السابقة محدودة للغاية، ما يعني أن العديد من الدراسات المتعلقة بعلم الأمراض، والاستجابة للأدوية، والطب الدقيق لم تعكس بشكل كامل الخصائص الجينية للشعب الفيتنامي. ولا يقتصر نجاح تطوير مشروع VN1K على استكمال البيانات المفقودة لفيتنام على خريطة الجينات العالمية فحسب، بل يساهم أيضاً في توفير مصدر بيانات واسع النطاق لجنوب شرق آسيا، إحدى أكثر المناطق التي تعاني من نقص في الموارد الجينية المتاحة حالياً.

قد يعجبك أيضاً
من البحوث الأساسية إلى التطبيقات التي تخدم الشعب الفيتنامي.
بالإضافة إلى بناء قاعدة بيانات للبحوث الأساسية، يهدف المشروع أيضاً إلى تطوير تطبيقات طبية حيوية مصممة خصيصاً للخصائص الجينية للشعب الفيتنامي.
باستخدام بيانات VN1K، حدد العلماء العديد من المتغيرات الجينية المرتبطة بالآثار الجانبية للأدوية الشائعة مثل كاربامازيبين، وألوبيورينول، وكلوبيدوغريل. وبناءً على ذلك، طور الفريق نماذج للتنبؤ باستجابات الأدوية استنادًا إلى الخصائص الجينية لما يقرب من 150 فئة دوائية، مما يساعد الأطباء في اختيار الأدوية وتعديل جرعات العلاج بشكل مناسب لكل مريض.
ومن الأمثلة الرئيسية على ذلك مشروع “الدواء المناسب للأطفال”، الذي يساعد آلاف الأطفال المحرومين المصابين بالصرع على تلقي الاختبارات الجينية قبل العلاج، مما يساهم في تقليل خطر حدوث ردود فعل دوائية خطيرة وتحسين فعالية العلاج.

فينجين تشيب – تطبيق الأبحاث عملياً
من أبرز إنجازات VN1K شريحة VinGenChip، وهي أول شريحة حيوية مصممة استنادًا إلى بيانات الجينوم البشري الفيتنامي. وقد طورتها شركة GeneStory بناءً على نتائج أبحاث VN1K، ويمثل هذا المنتج خطوة هامة نحو إتقان تقنية تصميم الشرائح الحيوية وتحليل البيانات الجينية في فيتنام.
تستطيع شريحة VinGenChip تحليل عشرات الآلاف من المتغيرات الجينية المميزة للشعب الفيتنامي في آنٍ واحد، مما يُسهم في تحديد الهوية الفردية، والتنبؤ بالاستجابة للأدوية، وفحص مخاطر الإصابة بالأمراض، وأبحاث علم الوراثة السكانية. وقد تم تحسين هذه التقنية خصيصًا لبيانات الجينوم البشري الفيتنامي، مما يعزز دقة التطبيقات العملية ويجعل تقنيات فك شفرة الجينات أكثر سهولة في الوصول إليها.
تُستخدم تقنية VinGenChip حاليًا في مشروع بنك الجينات للجنود الشهداء وأقاربهم، بالإضافة إلى حملة الدولة التي تستمر 500 يومًا للعثور على قبور الشهداء. تُسهم هذه التقنية في تحسين دقة مطابقة الحمض النووي بين الأقارب والرفات، مع خفض التكاليف بشكل ملحوظ مقارنةً بالعديد من الحلول المستوردة، مما يُسهم بفعالية في تحديد هوية الشهداء الذين تنقصهم المعلومات.
بالإضافة إلى ذلك، يتوقع فريق البحث أن يظل VN1K أساسًا للعديد من التطبيقات الجديدة في الطب الدقيق والطب الوقائي والرعاية الصحية الشخصية.
صرح البروفيسور فو ها فان، المدير العلمي لمعهد أبحاث البيانات الضخمة في جامعة فينوني ومبادر المشروع، قائلاً: “هذا مشروعٌ نفّذه علماء فيتناميون بالكامل، في فيتنام، من أجل الشعب الفيتنامي، وهو مشروعٌ رائدٌ يرسي الأساس لأبحاثٍ شاملةٍ حول الجينوم البشري الفيتنامي. ونأمل أن تكون هذه الخطوة الأولى في سلسلةٍ من الأعمال اللاحقة ذات القيمة الأكاديمية الكبيرة.”
وفي الوقت نفسه، صرّح الدكتور فو سي نام، الرئيس التنفيذي لمعهد أبحاث البيانات الضخمة بجامعة فينوني، والمؤلف المشارك الرئيسي للدراسة المنشورة، قائلاً: “منذ البداية، لم يكن هدفنا مجرد بناء قاعدة بيانات ضخمة وأدوات إحصائية وذكاء اصطناعي فعّالة للبيانات الجينية الفيتنامية، بل أيضاً إنشاء منصة لتحويل نتائج الأبحاث إلى منتجات. نتوقع أن يُسهم مشروع VN1K في تعزيز تطبيقات الطب الوقائي والطب الدقيق في فيتنام، بما يعود بفوائد عملية على الشعب الفيتنامي.”
المصدر:

