استكمال “الجزء” المفقود من خريطة الجينوم البشري الفيتنامي.
نشر فريق بحثي بقيادة الدكتور فو سي نام، المدير التنفيذي لمعهد أبحاث البيانات الضخمة بجامعة فينوني، والبروفيسور فو ها فان، المدير العلمي للمعهد، بحثًا بعنوان “VN1K: مورد متعدد الأوميات والفينوميات قائم على بيانات الجينوم الشامل للسكان الفيتناميين” في مجلة Nature Communications. ويُقدّم هذا البحث أول مصدر شامل وواسع النطاق لبيانات الجينوم، والأوميات المتعددة، والفينوميات الخاصة بالسكان الفيتناميين، كما نجح في تطوير مرجع الجينوم الشامل الفيتنامي (VPR) – وهو أول مرجع جينومي خاص بالسكان الفيتناميين.
تحت قيادة الدكتور فو سي نام والبروفيسور فو ها فان، أطلق أكثر من 40 عالماً فيتنامياً مشروعاً في عام 2018 لبناء قاعدة بيانات جينومية واسعة النطاق خاصة بالشعب الفيتنامي، مما أدى إلى إنشاء أساس لتعزيز تطبيقات علم الوراثة في الرعاية الصحية وخدمة المجتمع.
تم بناء قاعدة بيانات VN1K من بيانات 1011 شخصًا فيتناميًا من 53 مقاطعة ومدينة من أصل 63 (قبل إعادة التنظيم والدمج)، مسجلةً أكثر من 42 مليون متغير جيني، منها حوالي 8.5 مليون متغير لم تُسجل من قبل في قواعد البيانات الدولية الشائعة. وانطلاقًا من هذه القاعدة، طوّر فريق البحث برنامج VPR، الذي يُحسّن دقة تحليل وتفسير المتغيرات الجينية مقارنةً باستخدام الجينومات المرجعية، التي تُبنى في الغالب من بيانات سكانية أوروبية.
بحسب فريق البحث، كانت البيانات الجينية للشعب الفيتنامي في الدراسات الدولية محدودة للغاية، ما يعني أن العديد من الدراسات المتعلقة بالأمراض، والاستجابة للأدوية، والطب الدقيق لم تعكس بشكل كامل الخصائص الجينية للشعب الفيتنامي. ولا يقتصر نجاح مشروع VN1K على سدّ فجوة البيانات الخاصة بفيتنام على خريطة الجينات العالمية ، بل يساهم أيضاً في توفير مصدر بيانات واسع النطاق لجنوب شرق آسيا، إحدى أكثر المناطق التي تفتقر حالياً إلى البيانات الجينية.
وضع الأساس للطب الشخصي والعديد من التطبيقات العملية.
إلى جانب أهميتها البحثية الأساسية، يهدف مشروع VN1K أيضًا إلى تطبيقات مباشرة تخدم الشعب الفيتنامي. فمن خلال هذا المصدر من البيانات، حدد العلماء العديد من المتغيرات الجينية المرتبطة بردود الفعل السلبية تجاه بعض الأدوية الشائعة مثل كاربامازيبين، وألوبيورينول، وكلوبيدوغريل. وبناءً على ذلك، طور فريق البحث نماذج للتنبؤ باستجابات الأدوية استنادًا إلى الخصائص الجينية لما يقرب من 150 فئة دوائية، مما يساعد الأطباء في اختيار الأدوية وتعديل جرعات العلاج بما يتناسب مع كل مريض.
أحد التطبيقات التي تم تنفيذها هو مشروع “الدواء المناسب للأطفال”، والذي يساعد آلاف الأطفال المحرومين المصابين بالصرع على تلقي الاختبارات الجينية قبل العلاج لتقليل خطر حدوث ردود فعل دوائية خطيرة وتحسين فعالية العلاج.
استنادًا إلى نتائج مشروع VN1K، طورت شركة GeneStory أيضًا شريحة VinGenChip، وهي أول شريحة حيوية مصممة بناءً على بيانات الجينوم البشري الفيتنامي. تتميز هذه التقنية بقدرتها على تحليل عشرات الآلاف من المتغيرات الجينية المميزة للشعب الفيتنامي في آنٍ واحد، مما يُسهم في تحديد الهوية الفردية، والتنبؤ بالاستجابة للأدوية، وفحص مخاطر الإصابة بالأمراض، ودراسات علم الوراثة السكانية.
يُستخدم نظام VinGenChip حاليًا في مشروع بنك الجينات للجنود الشهداء وأقاربهم، بالإضافة إلى حملة البحث عن قبورهم التي تستمر 500 يومًا. يُسهم هذا النظام في تحسين دقة مطابقة بيانات الحمض النووي بين الأقارب والرفات، مع خفض التكاليف بشكل ملحوظ مقارنةً بالعديد من الحلول المستوردة. ووفقًا لفريق البحث، يُبرهن هذا على القدرة على تحويل نتائج البحث العلمي إلى تقنية تلبي الاحتياجات العملية للبلاد.
أوضح البروفيسور فو ها فان، في معرض حديثه عن أهمية المشروع، أن هذا البحث أُجري بالكامل على يد علماء فيتناميين في فيتنام، ولخدمة الشعب الفيتنامي، وهو بحث رائد يرسي الأساس لأبحاث شاملة حول الجينوم البشري الفيتنامي في المستقبل. وفي الوقت نفسه، أكد الدكتور فو سي نام أن هدف الفريق لا يقتصر على بناء قاعدة بيانات وأدوات ذكاء اصطناعي لبيانات الجينوم البشري الفيتنامي فحسب، بل يتعداه إلى تحويل نتائج البحث إلى تطبيقات تخدم المجتمع، وتسهم في تطوير الطب الوقائي والطب الدقيق في فيتنام.
المصدر: