نشر علماء في 22 يوليو/تموز في مجلة “نيتشر كوميونيكيشنز” مجموعة بيانات VN1K، التي تضم أكثر من 1000 جينوم. وأوضح الدكتور فو سي نام والبروفيسور فو ها فان، من معهد أبحاث البيانات الضخمة بجامعة فينوني – اللذين قادا المشروع – أن منصة بيانات الجينات هذه تُعد مرجعًا لمجموعة واسعة من الأبحاث والتطبيقات الجينية المتعلقة بالجينات البشرية الفيتنامية. ومن هذه التطبيقات تحليل الحمض النووي لتحديد هوية الجنود الشهداء.
| تُعد تقنية VinGenChip حاليًا إحدى التقنيات المستخدمة في المشروع الذي ترعاه الدولة لإنشاء بنك الجينات للجنود القتلى وأقاربهم، والمرتبط بحملة الـ 500 يوم. |
منذ أبريل من هذا العام، انطلقت حملة استمرت 500 يوم للبحث عن رفات الجنود القتلى وجمعها وتحديد هوياتهم، وقد جمعت الشركة أكثر من 100 ألف عينة. ووفقًا للبروفيسور فان، “يبلغ إجمالي عدد العينات التي جُمعت حتى الآن حوالي 100 ألف عينة”.
استنادًا إلى VN1K، طوّر الباحثون تقنية VinGenChip، وهي تقنية تُفكّ شفرة البيانات الجينية للأقارب بكفاءة عالية، مما يسمح بمقارنتها بالحمض النووي للرفات لتحديد هوية الجنود الشهداء. تتميز هذه الشريحة بقدرتها على تحديد المتغيرات الجينية الخاصة بالشعب الفيتنامي بفعالية أكبر من المنتجات المستوردة، وبسعر أقل بكثير.
تُستخدم حاليًا تقنية التسلسل الجيني من الجيل التالي NGS-SNP، التي تقرأ مواقع متعددة (SNPs) على تسلسلات الحمض النووي النووي في البقايا بدلًا من الحمض النووي للميتوكوندريا فقط كما كان سابقًا، لتحليل الحمض النووي من البقايا المتحللة بشدة. وتساعد هذه التقنية أيضًا في تحديد صلة القرابة بين الأفراد ذوي الصلة البعيدة، سواء من جهة الأب أو الأم.
بحسب الدكتور فو سي نام، تكمن ميزة تقنية NGS-SNP في شموليتها العالية، إلا أنه لا يزال من الصعب قراءة البيانات في الحالات التي تحتوي فيها عينة الرفات على العديد من أجزاء الحمض النووي التالفة نتيجة التحلل الشديد. تساعد بيانات VN1K في التغلب على هذا القصور، إذ توفر تردد جميع نقاط الجينات القابلة للقراءة على الجينوم الفيتنامي، وتحدد المواقع ذات القيمة المعلوماتية العالية في تحليل القرابة، فضلاً عن المساعدة في استعادة المواقع المفقودة جزئيًا. وبالتالي، يمكن مطابقة الرفات التي فقدت بياناتها الجينية جزئيًا مع بنك الجينات ذي الصلة لتحديد هوية الجنود الشهداء بدقة عالية.
أنشأت شركة GeneStory مختبرًا قادرًا على إجراء اختبارات جينية واسعة النطاق. ويوجد في فيتنام حاليًا أكثر من 175 ألف شهيد لم يُعثر على رفاتهم، وأكثر من 300 ألف قبر مجهول الهوية. وقال البروفيسور فو ها فان: “يبلغ عدد الاختبارات اللازمة لرفات الشهداء وأقاربهم ملايين الاختبارات، مما يتطلب مختبرًا ضخمًا، وهذه هي البنية التحتية التي نستطيع توفيرها”.
في غضون شهر واحد فقط منذ إطلاقها، جمعت GeneStory، بالتعاون مع الجهات المختصة، الحمض النووي لأكثر من 200 ألف شخص، وفككت شفرة أكثر من 50 ألف عينة جينية. ومن خلال هذه البيانات، تمكن العلماء من تحديد هوية أكثر من 30 جنديًا سقطوا في المعركة، من أصل حوالي 100 عينة رفات فقط تم تقديمها للمقارنة. وقال الدكتور فو سي نام: “في السابق، كنا نضطر إلى فحص عشرات أو مئات من عينات الرفات لتحديد عدد قليل من الحالات فقط”، مضيفًا أنه بفضل قاعدة البيانات الأكبر لجينات الأقارب والتكنولوجيا التحليلية المتطورة، ارتفع معدل تحديد الهوية بشكل ملحوظ.
يتوقع فريق البحث أن يظل مشروع VN1K منصة للعديد من التطبيقات الجديدة في الطب الدقيق والطب الوقائي والرعاية الصحية الشخصية، مما يساهم في تقريب إنجازات علم الوراثة من شعب فيتنام.
• راجع رابط المصدر:
المصدر: